Từ 2012 Ephata đã tham gia tổ chức các hoạt động STEM/STEAM cho học sinh ở một số trường phổ thông.
1. Trường tiểu học Nguyễn Bỉnh Khiêm, Q.1: Chương trình STEM (ngoài giờ lên lớp) được tổ chức hằng năm. Trung bình, mỗi năm học có khoảng 600 HS tham gia các khóa học STEM trong CLB Em Yêu Khoa Học.
2. Trường tiểu học Khai Minh, Q.1: HS khám phá STEM trong chương trình STEM ngoài giờ lên lớp. Mỗi năm có khoảng 200 HS tham gia các khóa STEM.
3. Trường THPT Bình Hưng Hòa: Chương trình STEM cho học sinh phổ thông trung học lớp 10 và lớp 11. HS khám phá STEM/STEAM qua việc thực hiện các dự án STEM khác nhau.
